（一）內設機構

共設2個內設機構，分別為辦公室（綜合管理科、行政服務科）和防災減災科（人工影響天氣辦公室），各內設機構的職責為：

1.辦公室（綜合管理科、行政服務科）

負責制訂全市氣象事業發展規劃并組織實施；負責監督有關氣象法律法規的實施，承擔組織宣傳、普及氣象科學知識等任務；承擔計劃財務、人事勞動、隊伍建設、教育培訓和項目管理等工作；負責黨的建設、精神文明和氣象文化建設工作。

2.防災減災科（人工影響天氣辦公室）

負責制訂全市氣象業務發展規劃和和氣象災害防御規劃，并組織實施；負責氣象災害防御、應急管理及人工影響天氣等工作；負責氣象監測、預報預警、公共服務等相關管理工作；負責氣象臺站、氣象設施及探測環境保護和探測資料管理等工作。

（二）直屬業務單位

共設2個直屬業務單位，分別為啟東市氣象臺和啟東市氣象災害防御中心，規格同地方政府同類直屬業務單位級別。各直屬業務單位的職責為：

1.啟東市氣象臺

負責氣象監測、預報預警工作；負責氣象探測資料的采集、傳輸和匯交；負責綜合探測系統、通信網絡的建設和維護運行工作。負責決策服務和行業、專業專項、為農氣象服務等工作；負責人工影響天氣作業及效果評價工作；負責氣候資源的綜合調查、區劃，氣候可行性論證工作；負責手機、廣播、電子屏等媒體氣象服務。

2.啟東市氣象災害防御中心

負責突發公共事件預警信息發布系統建設及運行、維護、管理工作；負責氣象災情調查評估、公報制作發布；負責人工影響天氣研究、作業試驗等工作；負責開展氣象災害科學防御研究、知識宣傳普及工作；協助承擔防雷服務市場監管業務工作，受委托協助開展防雷安全技術監督、質量標準執行情況檢查等工作。